不含染料的 MasterMix 產品在 PCR 結束后需混合適量的上樣緩沖液再上樣電泳, 含染料的 MasterMix 產品在 PCR 結束后可以直接上樣電泳。
不含染料的 MasterMix 產品在 PCR 結束后需混合適量的上樣緩沖液再上樣電泳, 含染料的 MasterMix 產品在 PCR 結束后可以直接上樣電泳。
(注意:以下舉例為常規PCR體系和反應條件,實際操作中應根據模板、引物結構和目的片段大小 不同進行相應的調整和優化) 1. PCR體系 推薦反應體系(20 μl)試劑用量模板 DNAPrimer 1 (10 μM)0.5 μlPrimer 2 (10 μM)0.5 μl2×Pfu PCR MasterMix10 μlddH2OUp to 20 μl(注意:引物濃度請以終濃度 0.1 - 1.0 μM 作為設定范圍的參考。擴增效率不高的情況下,可提高引 物的濃度;發生非特異性反應時,可降低引物濃度,由此優化反應體系) 2. PCR 程序過程溫度時間預變性94℃2 min變性94℃30 sec25 ~ 35cycles 退火55 ~ 65℃30 sec延伸72℃60 sec/kb最后延伸72℃5 min(注意:a 一般實驗中退火溫度比擴增引物的熔解溫度 Tm 低 5℃,無法得到理想的擴增效率 時,適當降低退火溫度;發生非特異性反應時,提高退火溫度,由此優化反應條件。b 延伸時間應 根據所擴增片段大小設定,Pfu DNA Polymerase 的擴增效率為1 kb/min。c 可根據擴增產物的下游 應用設定循環數。如果循環次數太少,擴增量不足;如果循環次數太多,錯配機率會增加,非特異 性背景嚴重。所以,在保證產物得率的前提下,應盡量減少循環次數) 3. 結果檢測:反應結束后取5 μl反應產物,加入適量上樣緩沖液(含染料的不用加), 然后進行瓊脂糖凝膠電泳檢測。
(注意:以下舉例為常規PCR體系和反應條件,實際操作中應根據模板、引物結構和目的片段大小 不同進行相應的調整和優化) 1. PCR體系 推薦反應體系(20 μl)試劑用量模板 DNAPrimer 1 (10 μM)0.5 μlPrimer 2 (10 μM)0.5 μl2×Pfu PCR MasterMix10 μlddH2OUp to 20 μl(注意:引物濃度請以終濃度 0.1 - 1.0 μM 作為設定范圍的參考。擴增效率不高的情況下,可提高引 物的濃度;發生非特異性反應時,可降低引物濃度,由此優化反應體系) 2. PCR 程序過程溫度時間預變性94℃2 min變性94℃30 sec25 ~ 35cycles 退火55 ~ 65℃30 sec延伸72℃60 sec/kb最后延伸72℃5 min(注意:a 一般實驗中退火溫度比擴增引物的熔解溫度 Tm 低 5℃,無法得到理想的擴增效率 時,適當降低退火溫度;發生非特異性反應時,提高退火溫度,由此優化反應條件。b 延伸時間應 根據所擴增片段大小設定,Pfu DNA Polymerase 的擴增效率為1 kb/min。c 可根據擴增產物的下游 應用設定循環數。如果循環次數太少,擴增量不足;如果循環次數太多,錯配機率會增加,非特異 性背景嚴重。所以,在保證產物得率的前提下,應盡量減少循環次數) 3. 結果檢測:反應結束后取5 μl反應產物,加入適量上樣緩沖液(含染料的不用加), 然后進行瓊脂糖凝膠電泳檢測。
1. 去除基因組:根據以下表格配制反應體系,總體積為 10μl。為了保證反應液配制的準 確性,先按反應數+2 的量配制預混體系,然后再分裝到每個反應管中,最后加入 RNA。10×gDNA Remover1 μlRNA 模板0.01~1μgDEPC-ddH2O補足至 10μl(注意:如果總 RNA 量大于 1 ug,請按比例擴大反應體系)將反應液輕輕攪拌均勻,短暫離心使管壁上的溶液收集到管底,室溫或 25-37℃溫育 5 分鐘。 2. 反轉錄反應:在上述反應液中加入 4μl 5×cDNA RT Mix,6μl DEPC-ddH2O,輕輕混勻, 短暫離心;50℃孵育 5-15 分鐘;85℃加熱 3 分鐘使酶失活;置于冰上進行后續實驗或 冷凍保存。 注意:Real-time qPCR 時,作為模板直接稀釋后添加(添加到 PCR 反應液中的反轉錄稀釋液,盡 量不要超過 20%,以免導致 PCR 反應效率低下,無法準確定量)
1. PCR 體系:推薦體系(50 μl)試劑用量模板 DNA10 × Taq PCR Buffer5 μldNTP Mixture(2.5 mM each)4 μlPrimer 1 (10 μM)2 μlPrimer 2 (10 μM)2 μlTaq DNA Polymerase (2.5 U/μl)0.5 ~ 1 μlddH2OUp to 50 μl(注意:a 引物濃度請以終濃度 0.1-1.0μM 作為設定范圍的參考。擴增效率不高的情況下,可提 高引物的濃度;發生非特異性反應時,可降低引物濃度,由此優化反應體系。b 鎂離子濃度請以 終濃度 1.5-3mM 作為設定范圍的參考??筛鶕煌囊飳湍0鍋碚{節鎂離子濃度,由此優化反應體系)2. PCR 程序過程溫度時間預變性94℃5 min變性94℃30 sec25~35cycles 退火55-65℃30 sec延伸72℃1kb/30 sec終延伸72℃5 min(注意:a 一般實驗中退火溫度比擴增引物的熔解溫度 Tm 低 5℃,無法得到理想的擴增效率時, 適當降低退火溫度;發生非特異性反應時,提高退火溫度,由此優化反應條件。b 延伸時間應根 據所擴增片段大小設定,Taq DNA Polymerase 的擴增效率為 1 kb/30 sec。c 可根據擴增產物的下 游應用設定循環數。如果循環次數太少,擴增量不足;如果循環次數太多,錯配機率會增加,非 特異性背景嚴重。所以,在保證產物得率的前提下,應盡量減少循環次數)3. 結果檢測:反應結束后取 5 μl 反應產物,加入適量上樣緩沖液后進行瓊脂糖凝膠電泳 檢測。